Bionimbus nube protegida de datos para permitir a los investigadores analizar los datos de cáncer

Abril 14, 2016 Admin Salud 0 0
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El Bionimbus Protegida nube de datos, como se le llama, permite a los investigadores que estén autorizados por los Institutos Nacionales de Salud (NIH) para acceder y analizar datos en el Atlas del Genoma del Cáncer (TCGA) sin crear ambientes seguros compatible con ellos la gestión y análisis de terabytes de datos, datos de descarga - que pueden tardar semanas - y luego instalar las herramientas apropiadas necesarias para realizar los análisis deseados.

Utilizando la tecnología que fue desarrollada en parte por la nube de datos Open Science, un proyecto de la Fundación Nacional para la Ciencia, apoyó que se está desarrollando una infraestructura de nube para grandes conjuntos de datos científicos, los datos Área Protegida Bionimbus ofrece a los investigadores un mecanismo más costo y tiempo efectivo para extraer conocimiento a partir de grandes cantidades de datos. Conocimientos de dibujo de grandes datos es necesario para abordar algunos de los desafíos del medio ambiente, salud y seguridad más problemático hoy.




"La tecnología de código abierto en la base de la nube de datos Ciencia Abierta permite a los investigadores para gestionar y analizar grandes conjuntos de datos que son cruciales para hacer frente a algunos de los mayores retos de hoy: de monitoreo ambiental para la genómica del cáncer", dijo Robert L . Grossman, director del proyecto Open Data Cloud Ciencia y profesor de la Universidad de Chicago.

Hoy en día, como el único, el tratamiento del sistema-NIH-aprobado para los datos del TCGA, los datos Área Protegida Bionimbus permite a los investigadores se centran en el análisis de gran secuenciación del genoma del cáncer, que los expertos creen que puede desbloquear caminos de diagnóstico precoz basado en la nube adecuada prevención y el cáncer.

"Estamos encantados de que los datos de Áreas Protegidas Bionimbus ahora se utiliza para los datos de genómica del cáncer para que los investigadores pueden trabajar más fácilmente con grandes conjuntos de datos para entender las variaciones genómicas que parecen ser una de las claves para el diagnóstico preciso y el tratamiento del cáncer ", continuó Grossman.

"Con los fondos aportados por las asociaciones NSF programa de Educación [PIRE] e Investigación Internacional para, NSF ha tratado de reducir la brecha entre la capacidad de los instrumentos científicos modernos para producir datos y la capacidad de los investigadores para acceder, gestionar, analizar, y compartir datos de manera confiable y oportuna ", dijo el Director del Programa NSF Harold Stolberg.

"Al adoptar el cloud computing como un problema global, este proyecto PIRE reúne la experiencia de muchos investigadores, no sólo en los EE.UU. sino en todo el mundo. Su éxito en ayudar a los investigadores a acceder y analizar información importante es un genoma del cáncer humano interesante indicador de la evolución futura de estas tecnologías ", dijo.

Megan McNerney, un instructor de patología en la Universidad de Chicago, Bionimbus utiliza para analizar los datos que condujo a su descubrimiento de que gen CUX1, que actúa como un supresor tumoral, se inactiva con frecuencia en la LMA.

"Bionimbus sido fundamental para mi trabajo, ya que se utilizó para todos los aspectos del proyecto, incluyendo el almacenamiento seguro de datos seguros, los resultados de control de calidad de secuenciación de próxima generación, alineación, análisis de expresión, y el desarrollo de algoritmos, "dijo. "La fuerza de Bionimbus, sin embargo, es el apoyo que se proporciona a los usuarios finales, lo que permitió a los miembros del equipo, tanto los expertos y no expertos en utilizar la nube."

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