Genoma Código agrietado de mama y de colon

Abril 19, 2016 Admin Salud 0 2
FONT SIZE:
fontsize_dec
fontsize_inc

Los científicos del Centro de Cáncer Johns Hopkins Kimmel han completado el primer borrador del código genético del cáncer de mama y de colon. Su informe, publicado en línea en el número de 07 de septiembre de Science Express, identifica cerca de 200 genes mutados, ahora vinculados a estos tipos de cáncer, la mayoría de los cuales no habían sido reconocidos como asociados a la iniciación del tumor, crecimiento, propagación o control.

"Así como la secuenciación del genoma humano ha sentado las bases para posteriores investigaciones en genética, estos datos ponen las bases para décadas de investigación sobre cáncer de colon y de mama", dice Victor Velculescu, MD, Ph.D., profesor asistente oncología del Centro Oncológico Kimmel de Johns Hopkins.

Aunque los descubrimientos de genes por parte de científicos independientes de todo el mundo han proporcionado pistas, Velculescu dice relativamente pocos genes han demostrado ser alterados en los tumores. Los cazadores de genes Hopkins dicen que el número de genes que han sido alterados en cáncer de mama y colorrectal genomas les sorprendió. "Esperábamos encontrar un puñado de genes, no 200", dice Tobias Sjцblom, autor principal e investigador postdoctoral en el Centro de Cáncer Kimmel de Hopkins.




A pesar de los beneficios potenciales en términos de biólogos del cáncer, los esfuerzos para mapear los genes del cáncer han provocado las críticas de otros que dicen que los dólares de financiación deberían gastarse en proyectos conseguir beneficios más inmediatos para la detección y tratamiento.

"Estos son buenos debates a tener", dice Kenneth Kinzler, Ph.D., profesor de oncología y codirector del Centro Ludwig de la Johns Hopkins, pero "estamos convencidos de que este tipo de estudio proporcionará una de las mejores hojas de ruta posible para vencer al cáncer. ¿Quién iba a dejar pasar la oportunidad de leer el plan de juego del enemigo? "

Algunas alteraciones genéticas ya han dado lugar a estrategias de detección y un tratamiento exitoso. Estos incluyen el fármaco cáncer de mama Herceptin - que se dirige a un receptor de células de cáncer de mama por el gen Her2-neu - y análisis de sangre para el cáncer de colon hereditario, basado en el gen APC y otros identificado del grupo de Hopkins.

"Los científicos de cáncer reconocen que sólo mediante la identificación de las piezas de ADN que tienen un papel en la enfermedad es un comienzo, no el final de nuestro trabajo", dice Bert Vogelstein, MD, investigador del Instituto Médico Howard Hughes y co-director del Ludwig Center en la Universidad Johns Hopkins, "pero con un enfoque más sistemático para identificar los genes que juegan un papel esencial en el cáncer, que será capaz de guiar el trabajo."

El equipo de Hopkins comenzó su proyecto con 11 muestras de cada uno de los cánceres de mama y colon, se retiran de los pacientes después de la cirugía. Dentro de cada célula tumoral, miles de millones de productos químicos individuales llamados nucleótidos par juntos de una manera programada para construir los peldaños de una escalera de ADN que componen las instrucciones genéticas. Cambios denominan mutaciones en los nucleótidos pueden crear errores que transforman una célula normal en una codificación canceroso.

Para localizar los nucleótidos alterados, los científicos compararon el código genético de sus muestras tumorales con las normales. En primer lugar, utilizaron el Proyecto Genoma Humano (PGH) para identificar las secuencias de los genes más conocidos - más de 13.000 en todo - alrededor de dos tercios del número total de genes identificados por el PGH. El número real de genes humanos es aún objeto de debate, pero se estima en alrededor de 20.000.

Luego, en cada tumor, los científicos examinaron el código de ADN de estos genes 13000 dividiendo cada gen en secciones superpuestas sobre - 10 por gen - 130000 para obtener secciones para análisis. Cada segmento se amplificó a través de una reacción en cadena de la polimerasa proceso llamado, purificado, y su secuencia determinada con más de tres millones de reacciones bioquímicas. Las secuencias fueron alimentados a través de software que responda a las secuencias normales con los de las muestras del tumor. El software ha destacado más de 800.000 regiones sospechosas que fueron inspeccionados visualmente, uno por uno, para verificar que eran verdaderas mutaciones que alteran el código de la proteína, en lugar de las variaciones normales o cambios menores que no tienen efecto en el producto del gen.

En total, el equipo de Hopkins peinado a través de 465 millones de nucleótidos - el valor de las cartas varias enciclopedias '- para encontrar aproximadamente 1500 nucleótidos de ADN que difieren del código normal de manera importante. Prácticamente todos estos errores eran simples de un solo nucleótido "erratas". Alrededor de 200 genes mutados fueron significativamente; los genes mutados en mama y de colon eran casi completamente distinta, lo que sugiere muy diferentes vías para el desarrollo de cada uno de estos tipos de cáncer.
Dice Kinzler, "Esto nos da una cierta comprensión de por qué el cáncer de colon y de mama, y ​​muy probablemente otros tipos de cáncer, son enfermedades muy diferentes y se desarrollan a través de diferentes procesos. Cuando decimos esto impulsará la investigación del cáncer para el próximo par de décadas, esta es una de las razones. Ahora, los investigadores estudiarán cómo se producen estas mutaciones en los cánceres de mama y de colon, tal vez en busca de agentes ambientales o procesos celulares que conducen a estos cambios ".

El equipo de Hopkins también encontró que el número promedio de genes mutantes en cada cáncer es de aproximadamente 100, y al menos 20 son susceptibles de ser crítico para la formación del tumor. "Cada cáncer tiene un proyecto diferente", dice Velculescu. "No hay dos pacientes que sean idénticos."

Otros tumores pueden evaluarse utilizando el enfoque de Hopkins, que se dice fue desarrollado en las últimas dos décadas y ha hecho posible a través de los últimos avances en la secuenciación del ADN y la bioinformática.

"Estos resultados servirán de guía y dar apoyo a los estudios genéticos completos futuros, incluidos los proporcionados por el proyecto Atlas del Genoma del Cáncer," dice Vogelstein. La investigación futura incluirá la realización de análisis similares en otros tumores, trazar las vías por las que cada uno mutantes gen actúa, y en busca de mutaciones comunes que pueden ser objetivo con medicamentos contra el cáncer o utilizar para diagnosticar la enfermedad antes.

Esta investigación fue apoyada por la Virginia y DK Ludwig Fondo para la Investigación del Cáncer, de los Institutos Nacionales de Salud, Departamento de Defensa, el Pew Charitable Trusts, Fundación Palmetto Health, Maryland cigarrillo Fondo de Restitución, Estado de Ohio Investigación Biomédica y Tecnología Comisión transferencia, Fondo Clayton, Fundación Blaustein, Nacional colorrectal Alianza de Investigación del Cáncer, Strang Cancer Prevention Center, Fundación Avon, asistente de vuelo Instituto de Investigación Médica y la Fundación V para la Investigación del Cáncer.

El equipo de investigación en la Universidad Johns Hopkins también incluye Siвn Jones, Laura D. Wood, D. Williams Parsons, Jimmy Lin, Thomas Barber, Diana Mandelker, Rebecca J. Leary, Janine Ptak, Natalie Silliman, Steve Szabo, Giovanni Parmigiani, Ben Ho Park y Nickolas Papadopoulos. Otros autores incluyen Phillip Buckhaults, Christopher Farrell, y Paul Meeh de la Universidad de Carolina del Sur; Sanford D. Markowitz de la Universidad Case Western Reserve, Hospitales de Cleveland y del Instituto Médico Howard Hughes de la Universidad; Joseph Willis y Dawn Dawson de la Universidad Case Western Reserve y Hospitales Universitarios de Cleveland; James KV Willson y Adi F. Gazdar de la Universidad de Texas Southwestern Medical Center; James Hartigan de Agencourt Bioscience Corporation; Leo Wu y Liu Changsheng de SoftGenetics LLC; y Kurtis E. Bachman en la Universidad de Maryland Greenebaum Cancer.

(0)
(0)

Comentarios - 0

Sin comentarios

Añadir un comentario

smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile smile smile smile smile
smile smile smile smile
Caracteres a la izquierda: 3000
captcha