Genoma del Cáncer Atlas completa el análisis detallado de cáncer de ovario

Mayo 22, 2016 Admin Salud 0 2
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El análisis de las variaciones genómicas del cáncer de ovario ha proporcionado una visión lo más completa e integrada de los genes del cáncer de cualquier tipo de cáncer a la fecha. Ováricos tumores adenocarcinoma seroso de 500 pacientes fueron examinados por el Atlas del Genoma (TCGA) Red de Investigación del Cáncer y los análisis se presentan en el 30 de junio 2011, de la revista Nature.

Adenocarcinoma seroso es la forma más común de cáncer de ovario, lo que representa alrededor del 85 por ciento de todas las muertes por cáncer de ovario. Investigadores del TCGA completaron la secuenciación del exoma, que examina las regiones codificantes de proteínas del genoma, en una cifra sin precedentes de 316 tumores. También completaron otras caracterizaciones genómicas de estos tumores y otros 173 especímenes.

TCGA es financiado y administrado por el Instituto Nacional del Cáncer (NCI) y el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI), ambos parte de los Institutos Nacionales de Salud en conjunto.




"Este importante estudio es producir conocimiento impresionante acerca de la biología de este tipo de cáncer", dijo el director del NIH Francis Collins, MD, Ph.D. "Va a mejorar significativamente la comunidad de investigación del cáncer para hacer descubrimientos adicionales que nos ayudará a tratar a mujeres con esta enfermedad mortal. También ilustra el poder de lo que está por venir de nuestra inversión en TCGA ".

Entre los hallazgos específicos es la confirmación de que las mutaciones en un solo gen, TP53, están presentes en más de 96 por ciento de todos los cánceres tales. TP53 codifica una proteína supresora de tumores que normalmente impide la formación de cáncer. Las mutaciones en el gen de interrumpir la función de esta proteína, lo que contribuye al crecimiento incontrolado de las células de ovario. Además, TCGA identificado una multitud de mutaciones menos frecuentes en otros genes.

Investigadores del TCGA también establecieron cómo grupos de genes se expresan de una manera que puede predecir la supervivencia de los pacientes - identificar patrones para 108 genes asociados con la supervivencia de los pobres y 85 genes asociados con una mejor supervivencia. Los pacientes cuyos tumores tenían una expresión genética asociada con una baja supervivencia vivió durante un período que fue del 23 por ciento menor que los pacientes cuyos tumores no tenían dicha firma. La tasa de supervivencia a los cinco años generales para el cáncer de ovario es el 31 por ciento, lo que significa que el 69 por ciento de los pacientes diagnosticados este año no va a estar vivo en el año 2016, destacando la necesidad urgente de una mejor comprensión de la enfermedad .

"El nuevo conocimiento de los cambios genómicos en el cáncer de ovario ha revelado que los catalizadores moleculares de esta enfermedad no se limitan a pequeños cambios que afectan a genes individuales", dijo el director del NCI, Harold E. Varmus, MD "También importantes son los principales cambios estructurales que se producen en estos investigadores genomas de cáncer. El cáncer puede utilizar este conjunto de información para entender mejor la biología del cáncer de ovario y para mejorar el diagnóstico y el tratamiento de esta terrible enfermedad ".

Para identificar las oportunidades de tratamiento dirigido, los investigadores buscaron los medicamentos existentes que podrían inhibir amplificados o sobre-expresados ​​genes que se han sugerido para desempeñar un papel en el cáncer de ovario. La investigación identificó 68 genes que podrían ser objeto existente por Food and Drug Administration ha aprobado o compuestos terapéuticos experimentales. Los investigadores observaron que un tipo de droga, un PARP (poli ribosa polimerasa ADP) inhibidor, podría ser capaz de contrarrestar el gen de reparación del ADN observado en la mitad de los tumores de ovario estudiados. Mientras que los investigadores han sabido que estos fármacos pueden ser eficaces contra la enfermedad, este estudio reveló que el 50 por ciento de los cánceres podría ser sensible a los fármacos que se aprovechan de la inestabilidad genética de los tumores e inducen a las células cancerosas a morir.

"Al igual que todos los tipos de cáncer, los resultados de cáncer de ovario de alteraciones genómicas," dijo Eric D. Green, MD, Director Ph.D., NHGRI. "Los esfuerzos de TCGA confirman que cuanto más aprendemos acerca de los cambios del genoma en las células cancerosas, más vamos a ser capaces de cuidar de las personas con cáncer."

Los resultados de este estudio apoyan la existencia de cuatro subtipos distintos de la enfermedad, basados ​​en los patrones observados en la transcripción de ARN a partir de ADN. También apoyan la existencia de cuatro subtipos relacionados metilación del ADN basado en modelos - una reacción química en la que una molécula pequeña llama un grupo metilo se añade a la del ADN, la modificación de la actividad de los genes individuales. Estos patrones probablemente reflejan cambios funcionales asociados adenocarcinoma seroso de ovario, pero no están fuertemente asociados con la duración de la supervivencia.

Las mutaciones en los genes BRCA1 y BRCA2, que se asocian con algunas formas de cáncer de mama, también confieren un riesgo aumentado de cáncer de ovario. En este estudio, alrededor del 21 por ciento de los tumores mostró mutaciones en estos genes. El análisis de estos tumores confirmó las observaciones que los pacientes con genes BRCA1 y BRCA2 mutados tienen una mejor oportunidad de supervivencia que los pacientes sin mutaciones en estos genes. Es importante destacar que los investigadores identificaron el mecanismo por el cual los genes BRCA1 y BRCA2 fueron dañados también se refiere a la supervivencia. Si uno de los genes BRCA1 y BRCA2 está mutado, se ha mejorado la duración de la supervivencia. Sin embargo, si la actividad se reduce sin embargo la metilación BRCA1, no hay mejora en la duración de la supervivencia.

"La integración de los conjuntos de datos genómicos complejos nos ha permitido descubrir una intrincada serie de cambios genómicos y validar un cambio específico que se produce en la gran mayoría de los cánceres de ovario", dijo el autor principal Paul T. Spellman, Ph. D., Lawrence Berkeley Lab, Berkeley, California. "Es importante destacar que, también encontramos la nueva información sobre el papel que los genes BRCA1 y BRCA2 juegan en la determinación de la supervivencia."

En este último estudio, los investigadores construyeron TCGA en el enfoque utilizado en 2008 para caracterizar el genoma de glioblastoma multiforme, la forma más común de cáncer cerebral.

TCGA, lanzado en 2006, es un esfuerzo global y coordinado para acelerar la comprensión de las bases moleculares del cáncer a través de la aplicación de tecnologías de análisis del genoma, incluyendo la secuenciación del genoma a gran escala. Datos del TCGA se están haciendo rápidamente a disposición de la comunidad científica a través de una base de datos, http://tcga-data.nci.nih.gov/tcga. La base de datos proporciona acceso directo a la mayor parte del conjunto de datos analíticos con otros datos, como los datos de los pacientes y los datos de tratamiento de secuencia de ADN en bruto, a disposición de los investigadores calificados a través de un proceso de revisión y aprobación de los NIH. Futuro análisis TCGA de más de 20 tipos de tumores se financiará principalmente con Ley de Recuperación y Reinversión (ARRA) dinero.

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