Importancia de los estudios de normalización de la detección de drogas

Mayo 21, 2016 Admin Salud 0 9
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Un experto en bioinformática en el IRCM, Benjamin haibe-Kains, publicó recientemente un artículo destacando la importancia de la normalización de los estudios de detección de drogas en la revista científica Nature. El estudio apoya la necesidad de un mayor desarrollo y estandarización para mejorar la reproducibilidad de los estudios de detección de drogas, ya que son importantes en la identificación de nuevos agentes terapéuticos y sus posibles combinaciones con los medicamentos existentes.

Artículo escrito por el Dr. haibe-Kains estudió los resultados de dos estudios a gran escala de la farmacogenómica - El Proyecto del Genoma del Cáncer (CGP) y la línea celular de cáncer Encyclopedia (CCLE) - publicado el año pasado en la revista Nature. El principal objetivo de estos estudios era identificar biomarcadores genómicos que pueden predecir la respuesta del paciente a medicamentos contra el cáncer. Debido a que los pacientes de cáncer a menudo muestran diferentes respuestas a los tratamientos contra el cáncer, y la evidencia indica que la respuesta está determinada en parte por las alteraciones del genoma de los estudios de línea, específicos para cada paciente de las células cancerosas han sido utilizados para probar la eficacia de agentes terapéuticos y explorar los factores asociados genómica respuesta a los fármacos. Estos dos estudios examinados más nuevos medicamentos aprobados en cerca de 1.000 paneles de líneas celulares de cáncer, incluidos 15 medicamentos y 471 líneas celulares eran comunes.

"Estos estudios nos proporcionó una oportunidad única de ver la reproducibilidad del descubrimiento de biomarcadores en entornos preclínicos," dice el Dr. haibe-Kains, Director de la Unidad de Investigación de Biología Computacional y Bioinformática de la IRCM. "Nuestro objetivo era examinar la uniformidad y las inconsistencias entre los resultados de dos estudios independientes, y evaluar el potencial para la construcción de modelos predictivos de respuesta a los medicamentos a base de estos resultados."




Su equipo de investigación Dr. haibe-Kains y se observa en general una buena consistencia de los perfiles genómicos, que contienen información sobre todos los genes en el cuerpo y se pueden utilizar para determinar la respuesta a un fármaco. Sin embargo, las medidas de sensibilidad a los medicamentos utilizados en los dos estudios fueron muy inconsistentes.

"Creemos que las razones de tales diferencias incluyen la falta de estandarización en las pruebas y métodos de análisis de datos experimentales," agrega el Dr. haibe-Kains. "Por ejemplo, los estudios probaron diferentes concentraciones de fármacos y se utilizan varios modelos estadísticos para analizar sus datos. Además, debido a las discrepancias en los datos de sensibilidad a los fármacos, algunos biomarcadores potenciales fueron inconsistentes entre los dos estudios."

"Estos estudios de farmacogenómica son generalmente el primer paso de un oleoducto experimental más amplio en el que los fármacos candidatos y biomarcadores están validados en estudios en animales y ensayos clínicos", dice el Dr. haibe-Kains. "Nuestros resultados confirman la necesidad de estandarización de las mediciones de la droga-respuesta, o el desarrollo de la nueva, robusta sensibilidad a los fármacos de prueba con el fin de identificar los factores predictivos de respuesta fiable genómico a las drogas o efectivamente identificar el mecanismo de acción de una droga."

"Es s importante señalar que nuestro estudio y las observaciones resultantes no podría haber sido posible si los datos no estaban bien documentados y puestos a disposición de la comunidad científica", concluye el Dr. haibe-Kains. "Este es un gran éxito para la ciencia y la investigación de los datos abiertos reproducible, y nos gustaría dar las gracias a los investigadores de los estudios y CGP CCLE que hicieron sus valiosos datos a disposición de los investigadores de todo el mundo. Sin esos datos, no seríamos capaz de descubrir discrepancias. Ahora tienen que trabajar juntos para mejorar la reproducibilidad de los estudios de cribado a gran escala con el fin de identificar nuevos agentes terapéuticos y sus posibles combinaciones con los medicamentos existentes ".

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