La comprensión de Enfermedades Infecciosas cómo Ala de acuerdo para desbloquear secretos celebrados en los datos existentes

Junio 3, 2016 Admin Salud 0 10
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A menudo son necesarios experimentos para hacer progreso científico, pero a veces las respuestas se encuentran en los datos ya recogidos, lo que requiere nuevas herramientas de análisis para descubrir los secretos. Esto se aplica a la transmisión de enfermedades infecciosas, el tema principal de un reciente seminario organizado por la Fundación Europea de la Ciencia (ESF), que prevé el desarrollo de nuevas herramientas matemáticas y estadísticas que pueden sondear más profundamente las bases de datos existentes en el área de contacto y patógenos humanos.

"Una de las más interesantes conclusiones a las que llegué fue la constatación de que grandes cantidades de información ya estaban disponibles en diversas bases de datos", dijo Mirjam Kretzschmar, coordinador del seminario de la ESF, del Centro Médico Universitario de Utrecht, los Países Países Bajos.

Estas bases de datos celebrada información sobre las redes de contacto de personas con diversas enfermedades de amplio alcance, la identificación del patrón de transmisión, y también el genotipo (secuencia genética total) de los patógenos asociados, que podrían ser bacterias o virus, y potencialmente en el futuro protozoos o micro hongos. El taller FSE destacó el gran reto que supone traer todos estos datos juntos, y sacar las conclusiones correctas de ella. "Y" Ahora está claro que los métodos aún faltan para desbloquear el conocimiento que se encuentra inmersa en estos datos ", dijo Kretzschmar. "En particular, tenemos que salvar diferentes disciplinas para responder a este reto de gestionar cada vez más grandes cantidades de datos de secuencias genéticas recopilado."




El punto aquí es que los patógenos particulares como el virus de la gripe, como identificados por su genotipo pueden tener diferentes patrones de transmisión - algunos podrían propagarse más rápido, y algunos pueden requerir un contacto más estrecho entre las personas a extenderse. Así relacionar los detalles de los contactos de la red que tienen lugar entre los enfermos, como se propagan las enfermedades, con la evolución del genotipo patógeno tal vez interesados ​​pueden producir información valiosa sobre los factores moleculares relacionados con la transmisión. Del mismo modo, la enfermedad puede ser más o menos severos con el tiempo, o puede afectar a ciertos tipos de personas peores que otros. Estos factores también pueden ser analizados, tal vez ayudar a identificar lo que hace que un patógeno peligroso y entonces esperemos predecir de antemano cómo puede desarrollar una infección y propagación. Esto puede conducir a estrategias adecuadas para luchar contra una enfermedad, como el desarrollo de una vacuna o de salud pública recomendaciones, por ejemplo, que algunos individuos de alto quedarse en casa, siempre que sea posible.

"Los proyectos de investigación han demostrado que la genotipificación de patógenos puede llevar a entender cómo las redes de riesgo están conectados entre sí y si el brote está constituido por muchos pequeños brotes locales o si son de un brote de una supra-nacional, que requiere diferentes estrategias de intervención ", dijo Kretzschmar. Por ejemplo, el brote de LGV (linfogranuloma venéreo) entre los hombres homosexuales en Europa durante el año 2005 se produjo en racimos y análisis mostró que los grupos de ciudades geográficamente distantes estaban conectados entre sí. Además, el análisis de los genotipos mostró que el brote se ha relacionado con casos anteriores observadas en San Francisco y fue pasando durante mucho tiempo ya. Esto ha ayudado a coordinar las actividades de intervención entre los países europeos.

La conferencia también escuchó cómo genotipado estaba ayudando a identificar los agentes patógenos emergentes con mayor rapidez que en el pasado, y sus modelos de transmisión probables. Por ejemplo genotipado permitió que el virus de insectos nacidos Chikungunya y sus vías de transmisión rápida identificación durante un brote reciente en Italia.

Esta información se puede correlacionar con las redes de investigación de contactos, que identifican las cadenas de transmisión tomadas por una infección. "Se examinaron dos tipos de localización de contactos", dijo Kretzschmar. "Uno de ellos era la forma tradicional de pedir a las personas infectadas que sus contactos y posibles fuentes de infección han sido, y el otro estaba trazando grupos de personas que tienen características similares."

Este último tipo de red de contactos podría ser identificado por tomar a las personas con genotipos similares, y considerando también las personas con el mismo tipo de conductas de riesgo que los pone en riesgo - hombres gay ya con tipos específicos de comportamientos de alto riesgo para ser un ejemplo para el LGV. "Esto demuestra que la tipificación molecular puede ayudar a las redes de destape en riesgo, especialmente si hay datos epidemiológicos disponibles, que nos permite localizar estas redes y para identificar a las personas que están en riesgo, pero aún no infectadas."

El taller FSE resultó muy valioso para la identificación de los tipos de datos que podrían aumentar la comprensión de cómo la enfermedad se propaga infecciosa y se propaga en las poblaciones, y las herramientas estadísticas y matemáticas capaces de realizar los análisis necesarios.

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