Lance un ciclo de silenciar la expresión de genes

Mayo 17, 2016 Admin Salud 0 9
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Todas las células humanas contienen esencialmente la misma secuencia de ADN - su información genética. ¿Cómo es que las formas y las funciones de las células en diferentes partes del cuerpo son tan diferentes? Mientras que el ADN de cada célula contiene el mismo plan maestro de construcción, existe un nivel adicional de regulación que determina cuál de los muchos programas de ADN posibles están activos. Este mecanismo implica modificaciones de las proteínas histonas genoma o con destino a la misma ADN con grupos químicos pequeños (por ejemplo, la metilación). Funciona en la parte superior de la información genética y por lo tanto se llama "genético-epi" por la palabra griega correspondiente que significa "arriba" o "unida a".

"La epigenética ha cambiado radicalmente nuestra visión de cómo la información genética se usa," dice el Dr. Karsten Rippe del German Cancer Research Center, que estudia este proceso con su equipo. "Los cambios epigenéticos se pueden establecer rápidamente o eliminados para cambiar de forma reversible de la función celular. Al mismo tiempo, los modelos epigenética puede ser heredada de forma estable a través de la división celular, y posiblemente también a la siguiente generación."

Resulta que el desciframiento de la célula "código epigenético 'es una tarea difícil: Cientos de proteínas en la célula están conectados en redes grandes a' escribir ',' Erase 'o' leer 'unos 140 modificaciones químicas diferentes de proteínas histona y el ADN que se han identificado hasta el momento. La comprensión de cómo la regulación epigenética opera a una parte específica del genoma, por tanto, requiere un enfoque integrado que tenga en cuenta las conexiones entre diferentes factores. En consecuencia, los investigadores, junto con sus colegas de la DKFZ y LMU de Mónaco de Baviera, se ha llevado a cabo un análisis exhaustivo de un prototipo epigenética red. Estudiaron cómo ciertas secuencias de ADN han sido silenciados por la metilación del ADN y las histonas que haría que el genoma inestable si está activo y que, por tanto, favorecer el desarrollo de cáncer.




Con base en los mapas de las marcas epigenéticas y de las interacciones de proteínas con el genoma, han desarrollado un modelo matemático para el silenciamiento epigenético. "El mecanismo de silenciamiento hemos encontrado obras como tirar un lazo con un lazo para atrapar algo", dice Katharina Müller-octubre, el primer autor del estudio: "Hay varios factores que se unen a la enzima silenciar permanentemente a sitios específicos en el genoma Desde el. ADN mueve aleatoriamente alrededor y forma transitoria bucle, la enzima afecta a otras regiones del genoma en las proximidades, que luego se convierten modificado y off ".

En virtud de su descripción cuantitativa de este proceso, los investigadores fueron capaces de predecir cómo la red reaccionaría silenciar en respuesta a las perturbaciones tales como variaciones en la abundancia de proteínas o la actividad de las enzimas implicadas. Los científicos de los grupos de Karsten Rippe y Thomas Hцfer el DKFZ continúan desarrollando y aplicando su modelo de señalización epigenético desregulado en la leucemia. Evaluación de mapas del genoma de señales epigenéticas con modelos matemáticos son la identificación de las variaciones específicas de tumor en muestras de células de pacientes con cáncer de la sangre. Por otra parte, se cortan como marcas epigenéticas pueden utilizarse para predecir la respuesta a la terapia y cómo las drogas afectan el programa de epigenética.

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