Mapa genómico que abarca más de dos docenas de tumores seguimiento

Mayo 21, 2016 Admin Salud 0 5
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Un equipo internacional de investigadores ha creado un mapa de la escala del genoma de 26 tipos diferentes de cáncer, revelando más de 100 sitios en los que el ADN genómico de los tumores falte o anormalmente duplicado en comparación con los tejidos normales. El estudio, el más grande de su tipo, señala que la mayoría de estas anomalías genéticas no son exclusivos de una forma de cáncer, pero son compartidas entre varios tipos de cáncer. El trabajo aparece en la edición del 18 de febrero de la Naturaleza.

"Nuestros hallazgos muestran que muchas alteraciones del genoma son universales en diferentes tipos de cáncer. Aunque esto ha sido conocido por algunos tipos de cambios, el grado en que se comparten tantos cambios fue bastante sorprendente para nosotros", dijo l ' autor principal Mateo Meyerson, profesor de Patología del Instituto del Cáncer Dana-Farber y miembro asociado senior del Instituto Broad de Harvard y el MIT. "Se sugiere que, en el futuro, una fuerza impulsora detrás de tratamiento del cáncer será alteraciones genómicas comunes, en lugar de tejido tumoral de origen."

Hoy en día, los tumores se caracterizan principalmente por sus síntomas: el órgano del cuerpo en que se producen, y antes de la aparición de las células cancerosas bajo el microscopio. Aunque esta información es valiosa, falla para resaltar la base molecular del cáncer ", que podría ser utilizada en el laboratorio para descubrir nuevas terapias contra el cáncer más eficaces, y clínicamente para mejorar el diagnóstico y el tratamiento. Un objetivo de la investigación biomédica moderna es llenar este vacío de conocimiento y describir todos los tipos de cáncer en base a lo que los impulsa - es decir, las aberraciones genéticas que inician y mantener el crecimiento del tumor.




En 2004, un equipo de científicos dirigido por investigadores del Dana-Farber y el Instituto Broad lanzó un proyecto para mapear sistemáticamente los cambios genéticos entre los diferentes tipos de cáncer. Se centraron en un tipo particular de cambio en el ADN que están presentes en copias anormales de segmentos del genoma de un tumor. En lugar de las dos copias normales, los tumores suelen llevar varias copias de un fragmento de ADN (una "amplificación") o pueden faltar por completo (un "borrado"). Estas anomalías genéticas se conocen como alteraciones o scnas número de copias somáticas.

Como otros tipos de mutaciones en el ADN que ensucian el genoma de las células cancerosas, la mayoría de scnas no necesariamente tienen un papel significativo en el crecimiento del cáncer. Pero aquellos que sirven como indicadores importantes que indican los genes específicos contenidos en ellos que ayudan a promover y mantener los tumores. El reto consiste en distinguir estos controladores llamados de su menor influencia.

Como base para su análisis, los científicos recolectaron más de 2.500 muestras de cáncer que representan a más de dos docenas de tipos de cáncer, incluyendo el de pulmón, próstata, mama, ovario, colon, esófago, hígado , cerebro y sangre cánceres.

"Estudios como este requieren un grupo grande y diverso de especímenes de tumores", dijo el primer autor Rameen Beroukhim, profesor asistente de oncología médica en el Instituto del Cáncer Dana-Farber y un investigador en el Instituto Broad. "Estamos profundamente agradecidos a nuestros colegas y sus pacientes que generosamente compartieron con nosotros las muestras."

Utilizando poderosa tecnologías genómicas "chip", los investigadores analizaron el ADN de estas muestras, y combinaron sus datos con los datos disponibles al público en otras 600 muestras de tumores de montar un catálogo detallado de scnas presentes en diferentes tipos de cáncer. Encontraron que los scnas más comunes tienden a venir en dos tamaños: relativamente largos, sobre la longitud de un cromosoma entero o un solo brazo del cromosoma, y ​​corto, con un tamaño medio de alrededor de 1,8 millones de letras genéticas o 0, 03% de todo el genoma humano.

Los investigadores han centrado su atención en el corto o focales scnas, que, debido a su tamaño relativamente compacto, capaz de facilitar la tarea de identificar los genes del cáncer importantes.

"Hasta hace poco, los métodos analíticos necesarios para apoyar este tipo de análisis no estaban disponibles", dijo el primer autor Craig Mermel, un estudiante de MD/PhD trabajando en el laboratorio de Meyerson y el Instituto Broad. "Los nuevos avances por parte de nuestro grupo, así como muchos otros han hecho posible mapear variaciones genómicas sistemáticamente a través de miles de muestras y de alta resolución."

De los 150 o así scnas focales identificados, Meyerson y sus colegas notaron que la mayoría no coinciden con los genes ya conocidos por ser amplificada o suprimido en el cáncer. Mirando más de cerca los genes que normalmente residen en estas regiones, los investigadores hallaron un enriquecimiento de genes importantes funciones biológicas del cáncer, como la muerte celular (o "apoptosis").

Este análisis ha permitido hacer luz sobre dos genes, MCL1 y Bcl2l1. Las células cancerosas con amplificaciones de estos genes parecen depender de la actividad de genes para la supervivencia, lo que sugiere un papel importante en el mantenimiento del crecimiento del tumor.

Quizás lo más importante, mirando a través de los datos para los diversos tipos de cáncer, se hizo evidente que la mayoría de scnas focales no son exclusivos de un tipo de cáncer, pero son compartidos entre múltiples tipos de tumores. En un análisis de 17 tipos diferentes de cáncer, los investigadores encontraron que la mayoría de las supresiones y amplificaciones están presentes en más de un tipo.

Esto sugiere que los mecanismos genéticos que son la base de estos tumores se comparten entre ellos, y podría algún día conducir a estrategias comunes para el tratamiento de los mismos.

"Estos datos indican un importante recurso para el descubrimiento del gen del cáncer, pero son sólo un primer paso", dijo Meyerson. "Con la revolución en curso en la tecnología del genoma, puede decodificar el genoma de miles de cánceres para revelar cada cambio genómico."

Estudio de Nature fue apoyada por los Institutos Nacionales de Salud, la Fundación Caritativa Doris Duke, el Thomas Monopoli pulmón Cancer Research Fund Sarah, la Corporación del Fondo del marinero para el cáncer de pulmón de Investigación y la Fundación Lucas.

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